喜报!重庆市畜牧科学院公开发布首个猪T2T基因组
【摘要】猪T2T基因组的组装为猪重要经济性状和特色性状挖掘及机理解析、猪基因组选育、猪品种遗传改良等提供了宝贵的资源。

作为生命密码的基因组一直是生命科学领域研究的热点话题,完整的基因组序列对解锁生命奥秘至关重要。为了补缺猪基因组信息,更好地开展猪遗传育种相关工作,依托国家重点研发项目“南方区地方猪新品种(配套系)培育及良繁”项目,重庆畜科院养猪研究所王金勇研究员团队与中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员团队合作,于2025年4月3日在imeta杂志(影响因子23.8)上公开发表了名为two telomere-to-telomere pig genome assemblies and pan-genome analyses provide insights into genomic structural landscape and genetic adaptations的文章,公开了首个目前最完整的猪T2T基因组(T2T_RCpig1.0),完整地组装了荣昌猪端粒到端粒的所有序列,总基因组大小为2.68Gb,contig N50大小约为143.96 Mb,预测了26,816个蛋白编码基因,注释了15112个非编码RNA。基于组装的基因组,初步解析了猪的复杂基因组区域,并通过泛基因组和多组学联合分析确定了与猪热适应性相关的结构变异(GIMAP6基因上游约1 kb处有一个226bp的缺失)。猪T2T基因组的组装为猪重要经济性状和特色性状挖掘及机理解析、猪基因组选育、猪品种遗传改良等提供了宝贵的资源。

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70013.

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