重庆市畜牧科学院武隆分院于2006年9月成立，办公场所位于重庆市武隆区畜牧发展中心。

武隆分院由重庆市畜牧科学院与重庆市武隆区人民政府联合组建的科技研发型事业单位，主要目的是开展武隆山羊、中蜂、土鸡、生猪等产业化发展关键技术攻关、品种开发利用、绿色健康养殖、决策咨询、平台建设、项目合作、科研成果转化、人才培养引进等相关工作，推进武隆山羊产业研究院（中心）建设。